Sunda piirkonna bioloogilise mitmekesisuse hotspot
imetajatel näiteks Malaisia mini-elevantidel tuleb toidu- ja kaaslaste otsinguil
ületada istanduste piirkondi eriti vihmastel hooaegadel, seda tehes tekitavad nad
kahju ja kibedat meelt põllupidajatele. Elupaikade fragmenteerumisest on mõjutatud
ka orangutangid, ninasarvikud, ahvid, kured (Ciconia stormi), madukaelad (Anhinga
melanogaster ) jpt. Koostöös WWF-iga on loodud jätkusuutlike istanduste programm.
Lisaks metsakeskkonnale on ohustatud ka Sunda piirkonna mereelustik.
Enamikes kalapüügi piirkondades toimub täismahus- või ülepüük. Samal ajal üritab
Indoneesia pidevalt suuroriental iucnendada kalapüüki, mis põhjustab
kalapopulatsioonide lähenemist väljasuremisele. Halvad kalandustaktikad ainult
süvendavad probleemi. Näiteks ookeani põhja traalimine krevetipüügil Arafura meres
Ida-Indoneesias, kus kaaspüügi osakaal on 10:1! Toimub ka absoluutselt