7.Võrdlev genoomne hübridisatsioon Comparative genome hybridization CGH (CGH 8.Mikrokiipide variandid, kasutamine, põhimõtted -Mikrokiibid on väikesed klaasi- või silikoonslaidid, mille pinnale on paigutatud sadu tuhandeid DNA fragmente -Teistel kandjatel n.n. nitrotselluloos järjestatud nukleiinhapete fragmente võib nimetada makrokiipideks -Kasutades erinevaid DNA hübridisatsiooniprotsesse mõõdetakse nende geenide ekspressioonitase -Andmed kogutakse kasutades laseraktiveeritud fluorestsentsloendureid -Kogu protsessi võib nimetada "ultra kiireks ja ökonoomseks" (ultra-high throughput") 21 Mutatsioon ja SNP analüüs, genoomi kaardistamine: Kõrgtihedusega oligonukleotiidkiibid. Mutatsioonikiibid nt. ATM, CFTR, BRCA1, HIV jaoks.Suuremahuline genotüpiseerimine. Võrdlev hübridiseerimine näitas 4000 SNP-i kahe pärmitüve vahel (Science 1999).Inimgenoomis 2,3 Mb ca 3000 SNP-i.
Nii saab teada, millised osad on vähiga genoomis üles ja/või puudu ja kas üldse on tegu vähiga. 8. Mikrokiipide variandid, kasutamine, põhimõtted Mikrokiibid on väiksed silikoon-või klaasislaidid, mille pinnale pandud tuhandeid DNA üheahelalisi sünteetilisi fragmente, mis kokku moodustavad uuritava geeni. Kasutades erinevaid hübridisatsioone mõõdetakse nende ekspressioonitaset, andmed kogutakse kasutades laseraktiveeritud fluorestsentsloendurit, kogu protsess "ultrakiire ja ökonoomne". Kuna kiibitehnoloogia on suhteliselt uus asi, siis on see eelkõige uurimistööriist. Loodetakse kasutada ulatuslikel populatsiooniuuringutel Kasutusvõimalused meditsiinis: · Haigusseoseliste geenide leidmine · Õige ravikuuri määramine · Ravimite kõrvalmõjude ja vastuse ennustamine · Täpse diagnoosi andmine, sadade eri parameetrite põhjal · Geenikoopiate arv (array CGH)