-"Stutter" produktid -Matriitsist sõltumatu nukleotiidi lisamine -Mikrovariandid -Null-alleelid -Mutatsioonid Mikrovariantsed alleelid ja redelivälised alleelid : -Mitte kõigil alleelidel ei ole täispikka kordusühikut -Osaliste kordusühikutega alleele tähistatakse: täiskorduste arv - punkt - aluste arv osalises korduses -Näide: TH01 9.3 alleel(AATG)6(-ATG)(AATG)3 Mikrovariandid: -Defineeritakse alleelidena, millel pole aluskordusmotiivi täpseid kordusi või esinevad kordusmotiivi järjestuse variandid või mõlemad -Võivad esineda insertsioonid, deletsioonid või aluse vahetused -Järjestuse variatsioon võib esineda korduse sees, külgnevas alas või praimeri seondumise saidis -Võib põhjustada PCR ebaõnnestumist, kui polümorfism praimeri saidis - "null alleelid" Null-alleelid: 15 -Alleelid esinevad, kuid ei amplifitseeru nukleotiidi muutuse tõttu praimeri seondumissaidis
Võrdluseks kasutatakse erinevatest proovidest võetud samu lookusi. 4. Mikrovariantsed STR alleelid (definitsioon, tähistamine) ja null-alleelid (esinemine, miks probleemsed). Kõigil alleelides ei ole täispikka kordusühikut osaliste kordusühikutega alleelide tähistamine: täiskorduste arv punkt aluste arv osalises korduses DEF: Alleelid, millel pole aluskordusmotiivi täpseid kordusi või esinevad kordusmotiivi järjestuse variandid või mõlemad Võivad esineda insertsioonid, deletsioonid, aluse vahetused Järjestuse variatsioon võib esineda korduse sees, külgnevas alas või praimeriga seondumise alas Võib põhjustada PCR ebaõnnestumist, kuid praimeriga seondumise sait on muteerunud: null-alleelid Alleelid esinevad, kuid ei amplifitseeru nukleotiidi muutuse tõttu praimeri seondumissaidis
annaabi.ee 
