Praktiline töö - SDS-PAGE PROTEOOMIKA
„Plaat” geeli vorm koosneb kahest paralleelsest klaasplaadist või plastiklehest, mille vahele
on asetatud tihendid (spacerid) vahemiku tekitamiseks ning geeli äravoolu takistamiseks
servadest.
SDS-PAGE elektroforeesi puhul kasutatakse kihilist kahe geeli kombinatsiooni. Esmalt
valatakse kahe plaadi vahele lahutav geel ning järgnevalt kontsentreeriv geel.
Kontsentreerivasse geeli asetatakse enne polümeriseerumist kammid, mille abil tehakse geeli
taskud proovide jaoks. Lahutav ja kontsentreeruv geel erinevad puhvri konsentratsiooni ja pH
poolest.
Pinge sisselülitamisel liiguvad anioonid anoodile (alumine elektrood) ning katioonid katoodile
(ülemine elektrood). Kui peenike joon liigub lahutava geelini algab eraldumine üksikuteks
bändideks väga kõrge resolutsiooniga. Iga bänd vastab ühele või mitmele polüpeptiidi tüübile,
mis omavad sarnast molekulmassi.
Mida raskem makromolekul seda rohkem on tema liikumine takistatud. Kui proov tungib läbi