alguspunkte. Fagemiid Plasmiid M13 1.Filamentse faagi 1.toodab palju 1. ringikujuline DNA ahel kujuna või plasmiidina; rekombinantset DNAd 2.laseb eraldada kloonitud DNA võib käituda nii 2.kasutatakse cDNA fragmendid üheahelalisel kujul (võimalik plasmiidina, kui ka kloonimiseks sekveneerida) faagina 3.Konjugatiivsed ja 3.ei tapa bakterirakku 2.stabiilne mitte, runway tüüp 4.F-spetsiifiline rekombinantne DNA 3.Üheahelaline DNA 4.Sobib suuremate fragmentide sisseviimiseks 12. Kuidas on võimalik ligeerida sisend vektorisse õige suunaga? Kõige lihtsam on lideerida kleepuvate otstega DNA fragmentdid. DNA fragmendi paigutamiseks vektorisse õige suunaga, kasutatakse 2 piiravat restriktsiooni ensüümi DNA läbitöötamiseks, et moodustaksid erinevad otsad
Piiravaks teguriks on relaksosoomi moodustumine, sest oriT äratundmiseks on vajalik spetsiifiline relaksaas. Ülekandumine on võimalik ainult siis, kui relaksosoomi valgud on ekspresseeritud väga lähedaselt plasmiidilt, mille relaksaas tunneb ära oriT. Pilar et. al (2010) võrdlesid kõiki plasmiide (kokku 1730 plasmiidi suurusega 0,8 kbp kuni 2 Mbp), mis 2009. aastal oli andmebaasidesse üles laaditud ning täielikud sekveneeritud. Kõigist prokarüootide plasmiididest 15% on konjugatiivsed, 24% mobiliseeritavad ning 61% mittekonjugatiivsed plasmiidid. Proteobakterite hulgas on konjugatiivseid plasmiide pisut rohkem, vastavalt konjugatiivseid 28%, mobiliseeritavaid 23% ning mittekonjugatiivseid 49%. Rohkem kui poolte plasmiidide mittemobiliseerumine näitab, et plasmiide ei saa pidada parasiitideks, mis püüavad ennast ohjeldamatult paljundada. Mobiliseeritavad plasmiidid on üldjuhul väiksemad kui konjugatiivsed
Antibiootikumide funktsiooniks on hoida prokarüootide populatsioonid tasakaalus. Virulentsusfaktorid toodavad vaksiine näiteks bakterofaagide vastu. 3. selle toimel teised bakteritüübid muutuvad nendetaolisteks, kest hakkab läbi laskma. Plasmiidide klassifitseerimine 1. Sobivus samas sobivusklassis olevad plasmiidid ei saa eksisteerida samas rakus. 2. Kitsa-pereemeeste ringiga plasmiidid ja laia-peremeeste-ringiga. 3. Konjugatiivsed plasmiidid kanduvad ühest rakust teise. Fenotüüp · Bakterite kasvu testimine erinevatel söötmetel võimaldab kirjeldada nende fenotüüpi. · Bakterigeneetikas kasutatakse analüüsimiseks erinevaid mutante selektiivsetel söötmetel: Antibiootikumide resistentsed mutandid; Auksotroofsed mutandid ei kasva minimaalsel söötme (prototroofid); Süsinikuallika mutandid; Faagiresistentsuse