peptiid komplekse. 2 25. Kuidas määravad MHCd valguliste antigeenide immunogeensuse? 2 26. T-lümfotsüütide antigeensete retseptorite ( TCR ) struktuur. ja retseptorite osakaal ja võrdlus. 2 27. TCR genoomsete lookuste struktuur ( inimene, hiir ) 2 28. Repertuaari genereerimine T-lümfotsüütides – rekombineerumised lookustes. 4 29. Võrrelge antigeensete retseptorite repertuaari genereerimise mehhanisme B- ja T-lümfotsüütidel. 4 30. MHC-peptiid-TCR kolmikkompleksi topoloogia. Erinevused MHCI ja MHCII korral. 2 31. CD3 kompleksi struktuur ja funktsioon. 2 32. Lisaretseptorid T-lümfotsüütide aktivatsioonil. Jaotus funktsioonide alusel. Näiteid. 2 33. Obligatoorsed retseptorite paarid T- ja B-lümfotsüütide vastastikusel aktivatsioonil. 2 34. Spetsiifilised lisaretseptorid CD4 ja CD8. 2 35. retseptoritega T-rakkude osalemine immuunüsteemis. 4 36. Võrdle ja retseptoritega T-lümfotsüütide
Foolhappe süntees. Sulfonüülamiid-inhibeerib foolhappe sünteesi DNA topoisomeraaside inhibitsioon Norfloksatsiin Rakukesta sünteesi inhibitsioon Penitsiliin, Vankomütsiin Antibiootikumide väljatöötamise ajalugu Sulfonüülamiidid. Esimest korda oli sünteesitud aastal 1908. 1932 – protnosiil. Gerhard Domagk. Penitsilliin- 1929, FLEMING Streptomütsiin- 1944, Albert Schatz, Selman Waksman Tetratsükliini mõju kolmikkompleksi seondumisele ribosoomiga. Tetratsükliin seondab Asaidi lähedusse ja pärsib tRNA seonduist ribosoomiga. Aminoglükosiidide mõju translatsiooni täpsusele Aminoglükosiidid seonduvad A-saiti väiksele subühikule. Vastupidiselt tetratsükliinile seondavad aminoglükosiidid tRNA-d palju tugevamini ning seega ei toimu translokatsiooni. 27
üheahelaliseks DNA-ks. Sellest johtuvalt on RNAP ees positiivne superspiralisatsioon, mida güraas leevendab. RNAP taga on negatiivne superspiralisatsioon, mida TopA leevendab. Transkriptsiooni terminatsioon saab toimuda kahel viisil: Rho-sõltuv ja -sõltumatu terminatsioon. Rho faktorist sõltumatu terminatsioon toimub juuksenõela struktuuri abil. GC-rikkad kordusjärjestused tekitavad RNA-l stabiilseid juuksenõelastruktuure, mis seonduvad RNAP-ga ning destabiliseerivad kolmikkompleksi. Termineerumist soodustab GC-korduste järel olev T-rikas piirkond, mis vastab RNA-l U-rikkale järjestusele, mis soodustab kolmikkompleksi lagunemist. Rho-sõltuv terminatsioon toimub tavaliselt RNA-l, mida ei transleerita. Rho seondub RNA-l rut (inglise keeles rho utilization site) järjestusele, mis on C-rikas, ning kasutades ATP-d liigub mööda RNA-d polümeraasile järele, seondub RNAP-ga ning põhjustab kolmikkompleksi lagunemise (DNA-RNA kompleksi). RNAP jääb
GTP.aa-tRNA.RSA 3 aa-tRNA.RSA + EF-Tu.GDP+ Pi pep-tRNA.RSE 4 aa-tRNA + RSA , 28 kus RSA on vaba A saidiga ribosoom, RSE on ribosoom peale peptiidsideme moodustumist, Pi on anorgaaniline fosfaat, mis tekib GTP hüdrolüüsil. Numbritega on tähistatud reaktsioonid: 1. on aa-tRNA valiku esmane etapp. See reaktsioon on pöörduv, stabiilne kompleks ribosoomi ja kolmikkompleksi vahel tekib ainult siis kui vähemalt kaks järjestikust antikoodoni nukleotiidi paarduvad mRNA koodoniga. 2. reaktsioon on GTP hüdrolüüs EF-Tu'l, mida indutseerib koodon antikoodon paardumine. 3. reaktsioon on peptiidsideme süntees, mille tulemusel tekib üha aminohappe võrra pikem peptidüül-tRNA. See reaktsioon viib peptiidahela pikenemisele. 4. reaktsioon on mitteproduktiivne dissotsiatsioon peale GTP hüdrplüüsi. Seda protsessi nimetatakse ka "proofreading'uks" e
Need mutatsioonid viivad ülitäpsele valgusünteesile ja neis bakteritüvedes toimub nonsens supressioon väga väikese efektiivsusega. Ribosoomidel toimuvat kaheastmelist aa-tRNA valikut iseloomustab järgmine skeem: RS A – vaba A-saidiga ribosoom RS E – peale peptiidsideme moodustumist ribosoom Pi – anorgaaniline fosfat (tekib GTP hüdrolüüsil) 1. aa-tRNA valiku esmane etapp, pöörduv. mittepöörduv (stabiilne) kompleks (ribosoomi ja kolmikkompleksi vahel) tekib siis, kui vähemalt kaks järjestikust antikoodoni nukleotiidi paarduvad mRNA koodoniga. 2. GTP hüdrolüüs EF-Tu-l, indutseerib koodon-antikoodon paardumine 3. peptiidsideme süntees, tekib üha AH võrra pikem peptidüül-tRNA. Peptiidahel pikeneb nii 4. peale GTP hüdrolüüsi mitteproduktiivne dissotsiatsioon – proofreading ehk veeruparandus. Surppressor tRNA-d - vähemvõimekad – ei lülita mitte iga valikutsükli käigus AH peptiidi.