Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
etc).
-Ekstreemsed proovid?
-Koduhoidjad (housekeeping) geenid = kontrollgeenid
-Intensiivsusest sõltuv (tavalisene): globaalset intensiivsust või globaalset suhet kasutades
arvutatakse üks normaliseerimifaktor
Mikrokiipidel põhinevad valk-DNA seostumiskohtade uuringud:
-Kaardistamine kasutades kromatiini immunopretsipitatsioonitehnikaid ja kiipe.
-----Valgud ristseotakse (crosslinking) genoomsele DNA-le in vivo.
-----DNA lõigatakse ensüümidega või mehhaniliselt
-----DNA-valk kompleksid immunopretsipiteeritakse
-----Eri allikatest pärit (kotroll ja test DNA) kompleksidega seostatakse linkerid ja
amplifitseeritakse ning märgistatakse erinevate värvidega
-----Tulem hübridiseeritakse kiipidele
-----Mida erinevam on signaali erinevus fragmentide vahel, seda tugevam on valkude
seostumine antud fragmendiga
-Kaardistamine kasutades DNA adeniin metüültransferaasi määramist
------DNA adeniin metüültransferaas seotakse kromatiiniga seostuvatele valkudele ja
ekspresseeritakse rakkudes