Tartu linna ajalugu
juhatas seda aastani 1837. Osales Tartu ülikooli põhikirja koostamises ja ülikooli
tegevuse juhtimises. 1826. aastal valiti ta Peterburi Teaduste Akadeemia auliikmeks.
Morgensternil on suuri teeneid kunsti propageerijana Eestis. Tema kirjutatud on
siinne varaseim kunstialane brosüür "Über einige Gemälde" (Dorpat, 1805)
Avaldanud kirjandus- ja kunstiküsimusi käsitlevaid aktusekõnesid ning kunstikirjutisi
saksa ja baltisaksa ajakirjanduses. Koostas 1815. aastal esteetikakursuse õppekava.
Morgensterni kunstikirjutiste temaatika ulatub antiikkunstist kaasaegse Lääne-
Euroopa ja baltisaksa kunstini. Erilist huvi tundis ta Raffaeli loomingu ("Über Raffael
Sanzio's Verklärung", Dorpat, Leipzig, 1822) ja kaasaegse kunsti vastu; kirjutistes
põimuvad klassitsislikud ja romantilised arusaamad. Oma rikkaliku käsikirjapärandi
ning raamatu- ja kunstikogu kinkis Tartu ülikoolile. Joonistajana oli asjaarmastaja,
visandas maastikuetüüde, portreid, kopeeris 16