Eukarüootsel initsiaator-tRNA-l on N1:N72 aluspaardumine säilunud. Kuid T-lingus puudub TΨ-järjestus. Antikoodon-heeliksis paikneb kolm iseloomulikku G:C aluspaardumist. precursor-tRNA protsessimise etapid. tRNA geenide esmased transkriptid omavad 5'- ja 3'- otstes lisajärjestusi ja funktsionaalsete tRNA molekulide moodustumiseks peavad nad läbima protsessingu. tRNA transkripti 5’ otsas paikneva liigse järjestuse eemaldab endoribonukleaas RNaasP, mille variant on olemas kõikides organismides. RNaasP omab nii RNA komponenti kui ka valgulisi subühikuid. Üldiselt leiab 5’ otsa protsessing aset enne 3’ otsa protsessingut. tRNA geeni transkripti 3’ poolne protsessing on komplitseeritum. Erinevaid protsessingu radasid võidakse kasutada isegi ühe ja sama organismi piires. Esmalt lõikab prekursorit 3’- otsast endoribonukleaas RNaasE. Seejärel treivad eksoribonukleaasid RNaas PH ja RNaas T
Kasutatakse taimede puhul. Kasutatakse ka lühendit PTGS/RNAi. quelling - sama tähendusega termin Neurospora puhul. (quelling Ingl. k. - lämmatama, maha suruma) dsRNA - kaheahelaline RNA (double stranded) on RNAi oluline vahendaja. RdRP - RNA sõltuv RNA polümeraas suunab RNA sünteesi RNA matriitsi alusel, mille tulemuseks on dsRNA. See ensüüm ei ole RNAi toimumiseks vajalik kui rakus on suur kogus dsRNA'd. RNaas III - dsRNA spetsiifiline endoribonukleaas, mis hürdolüüsib rohkem kui 10 aluspaarise dsRNA fosfodiestersidemed. RNAi puhul toimub pikkade dsRNA'de lagundamine väiksemateks fragmentideks (21-25 aluspaari), mida viivad läbi RNaas III homoloogid, näiteks Drosophilas valk nimega Dicer. siRNA - vaigistamist indutseeriv RNA on RNaas III sarnaste ensüümide hüdrolüüsi produkt, 21-25 nt pikk, mis on kas "sense" või "antisense" järjestuse orientatsiooniga. RISC - RNA indutseeritud vaigistuskompleks (RNA induced silencing complex)
PTGS – post transkriptsiooniline geeni vaigistamine (silencing). Taimede puhul. Kasutatakse lühendit PTGS/RNAi quelling – sama tähendusega termin Neurospora puhul (maha suruma) dsRNA – kaheahelaline RNA – double stranded – RNAi oluline vahendaja RdRP – RNA sõltuv RNA polümeraas suunab RNA sünteesi RNA matriitsi alusel, mulle tulemuseks on dsRNA. Pole RNAi toimumiseks vajalik kui rakus on suur kogus dsRNA-d RNaas III – dsRNA spetsiifiline endoribonukleaas, mis hüdrolüüsib rohkem kui 10 aluspaarilise dsRNA fosfodiestersidemeid. RNAi puhul toimub pikkade dsRNA-de lagundamine väiksemateks fragmentideks (21-25 aluspaari), mida viivad läbi RNaas III homoloogid, nt Dorsophilas valk nimega Dicer. siRNA – vaigistamist indutseeriv RNA on RNaas III sarnaste ensüümide hüdrolüüsi produkt; 21-25 nukleotiidi pikk, mis on kas „sense“ või „antisense“ järjestusorientatsiooniga. antisense RNA –
Et kui bakter satub toitaineterikkasse keskkonda, siis uuesti sünteesitud antitoksiin RelB inhibeerib RelE toime ning bakter muutub metaboolselt 93 aktiivseks. Osa teadlasi arvab, et toksiin-antitoksiin süsteemidega pole võimalik bakteri metabolismi reaktiveerida. 11.1.1. MazEF-süsteem E. coli toksiin-antitoksiin süsteem. MazF on toksiin ja MazE on antitoksiin. MazF on endoribonukleaas, mis tunneb ära mRNA-l ACA järjestuse ning lõikab mRNA katki esimese A ja C vahelt. MazE pool eluiga on umbes 30 minutit ning MazE on degradeeritav ATP-st sõltuva proteaasiga ClpAP. MazF on stabiilne, selle pool eluiga on umbes 4 tundi. Kui rakud on näljastressis ning aminohapete puudusel suureneb alarmooni ppGpp kontsentratsioon rakus, siis ppGpp pärsib mazEF operonilt transkriptsiooni. Kuna MazE on lühema elueaga, siis proteaasid