Valkude ruumilised struktuurid
Polüpeptiidahel omandab keraja (globulaarne
valk) või niitja (fibrillaarne valk) konformatsiooni. Tertsiaarstruktuuri stabiliseerivad peamiselt
kõrvalahelate (R-rühmade ehk radikaalide) vahelised vesinik- ja ioonsidemed.
· Globulaarsed valgud:
Struktuuride tüübid:
· Antiparalleelse alfa-helikaalse struktuuriga valgud
· Paralleelse või segatüüpi beeta-leht struktuuriga valgud
· Antiparalleelse beeta-leht struktuuriga valgud
· Metalli- ja disulfiidirikkad valgud
Pakkimise põhimõtted:
· Peptiidahel peab pakkimisel arvestama piirangutega, mis tulenevad tema struktuurist
· Peptiidahel pakitakse nii, et hüdrofoobsed jäägid peidetakse gloobuli sisemusse, millega
väheneb nende kontakt veega.
· Peptiidahelal, mis koosneb L aminohapetest, on kalduvus ,,parema käe pöördele"
· Alfa-heeliksid ja beeta-lehed pakitakse sageli kihtidena, kus hüdrofoobsed jäägid on peidetud
kihtide vahele