Ntks: trp operoni liiderjärjestus on võimeline moodustama alternatiivseid sekundaarstruktuure. Kui omavahel paarduvad nukleotiidid regioonidest 1 ja 2 ning 3 ja 4, moodustuvad sekundaarstruktuurid, mis termineerivad transkriptsiooni, kui aga omavahel paarduvad nukleotiidid regioonidest 2 ja 3, on terminatsiooni põhjustavate juuksenõelastruktuuride moodustumine takistatud ning transkriptsioon jätkub. 50. Seleta lühidalt antiterminatsiooni mehanismi põhimõtet. Kasuta oma selgituses jooniseid. Antiterminatsioonil on kirjeldatud 2 mehhanismi: (1) RNA polümeraasi modifitseerimine nii, et transkriptsioon ei termineeru terminaatorjärjestusel (faag lambda terminaatorid, rrn operonid). (2) Terminaatori moodustumine on takistatud valgulise faktori abil, mis seondub mRNA-ga. Teisel juhul seondub transkribeeritava geeni liiderjärjestusele antiterminaator-valk, moodustub alternatiivne sekundaarstruktuur, mis kattub
Tänu moodustuvatele sekundaarstruktuuridele tekib võimalus transkriptsiooni regulatsiooniks läbi elongatsiooni ja terminatsiooni mõjutavate faktorite. NusA on multifunktsionaalne elongatsioonifaktor, mis stimuleerib teatud tüüpi pausingut (näit. trp ja his operonide sekundaarstruktuuridel) ja Rho-sõltumatut transkriptsiooni termineerumist. Indutseerib anti- terminatsiooni Rho-sõltuvatelt terminaatoritelt. Antiterminatsiooni kompleksis teiste faktorite juuresolekul takistab termineeruva sekundaarstruktuuri teket. Attenuatsioon Parasjagu sünteesitavalt mRNA-lt algab kohe ka translatsioon, see võimaldab reguleerida transkriptsiooni termineerumist transkriptsiooni ja translatsiooni elongatsiooni kiiruste kaudu. Regulatsioon toimub spetsiifilistelt liiderjärjestustelt, millel on potentsiaal moodustada RNA sekundaarstruktuure ning sellesse ei ole kaasatud regulaatorvalke. mRNA stabiilsus
Kaks promootorit ja neid reguleeritakse erinevalt. P1 – konstitutiivselt aktiivne; P2 - lülitatakse sisse, kui on väga head kasvutingimused. Kaks terminaatorit – toimivad sigmasõltumatult. Kõige tugevamad prokarüootide terminaatorid. Termineerivad ka võõrpolümeraase. Kahte terminaatorit on vaja, et terminatsiooniresistentset polümeraasi ikkagi peatada. Valgu geene siin operonis pole. Kuidas kaitsta sigmasõltuvat terminatsiooni eest. Selleks antiterminatsiooni cis- elemendid ja faktorid. cis-elemendid on nut - saidid. cis-elemendid toimivad antiterminatsioonifaktorite abil. antiterminatsiooniboksid: box A – primaarstruktuuride element. 53 box B – RNA sekundaarstruktuuri element. Antiterminatsiooni cis-elemendid – nut – sait. Antiterminatsiooni järjestuselemendid töötavad RNA tasemel. RNA polümeraas alustab ja mingi hetk terminatsiooni saidid vabastavad antiterminatsioonifaktorid.
transkriptsioonikompleksist. Sellised terminaatorsignaalid paiknevad sageli operonide lõpus mittetransleeritavates järjestustes pärast stop koodoneid (näiteks trp operoni lõpus). Mittetransleeritavate RNA-de (rRNA ja tRNA) transkriptsiooni peatumist või termineerumist soodustavad nendele molekulidele iseloomulikud sekundaarstruktuurid. Selleks, et vastavaid geene siiski transkribeeritaks, vajatakse spetsiaalseid antiterminatsiooni faktoreid nagu näiteks Nus valk (N-utilization, kirjeldatud esmalt faag lambda puhul) ja ribosoomi valk S10. Transkriptsiooni attenuatsioon Bakteritel on transkriptsioon ja translatsioon omavahel väga tihedalt seotud: parasjagu sünteesitavalt mRNA-lt algab kohe ka translatsioon. Nende kahe protsessi praktiliselt samaaegne toimumine võimaldab reguleerida transkriptsiooni termineerumist transkriptsiooni ja translatsiooni elongatsiooni kiiruste kaudu.
transkriptsioon lõpetatakse luues umbes 140 aluseline baas-transkript. · See kontrollmehhanism mõõdab saadava laetud Trp-tRNA hulka. Ribosoomide asukoht määrab struktuuri, ka teisi operone kontrollitakse attenuatsiooni teel. Avastus viis paljude selliste operonide taasavastamiseni, mille repressoreid polnud kunagi leitud. 18 57. Seleta lühidalt antiterminatsiooni mehanismi põhimõtet. Kasuta oma selgituses jooniseid. Antiterminatsioon on prokarüootsete rakkude abistamine parandamaks varajast RNA sünteesi terminatsiooni transkriptsiooni käigus. See toimub, kui RNA polümeraas ignoreerib terminatsiooni signaali ja tekitab mehhanismi, kuis üks või enam geeni operoni lõpus võivad olla sisse või välja lülitatud, sõltuvalt sellest, kas polümeraas tundis ära terminatsiooni signaali või mitte