Bioinformaatika ülesanded
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Lokaalsel joondamisel näen, et järjestuste keskel esineb mittevastavus. Seda näitab ka punktis
7 tehtud globaalne joondamine ja ka DotPlotiga saadud tulemus.
2. punkti kolmanda järjestuste paari lokaalne joondamine:
########################################
# Program: water
# Rundate: Wed Mar 07 18:22:06 2007
# Align_format: srspair
# Report_file: /ebi/extserv/old-work/water-20070307-18220593324593.output
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: EMBOSS_001
# 2: EMBOSS_001
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 662
# Identity: 507/662 (76.6%)
# Similarity: 507/662 (76.6%)
# Gaps: 144/662 (21.8%)
# Score: 2371.5
#
#
#=======================================
EMBOSS_001 110 ttgatcacttgaactctaaagattttattgggggcaatctccaagaatta 159
|||||.|.|||||||||||||||||||||.|..||