Bioinformaatika ülesanded
skoorimaatrikseid ja tühikutrahve. DotPlot näitab erinevaid variante, kuid EMBOSS
näitab ainult kõige optimaalsemat varianti. EMBOSS näitab kokkulangevust
piirkonnas esimese järjestuse 251. nukleotiidist ja teise järjestuse 1. nukleotiidist.
2. punkti teise järjestuste paari globaalne joondamine:
########################################
# Program: needle
# Rundate: Wed Mar 07 18:05:51 2007
# Align_format: srspair
# Report_file: /ebi/extserv/old-work/needle-20070307-18055071012377.output
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: EMBOSS_001
# 2: EMBOSS_001
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 696
# Identity: 566/696 (81.3%)
# Similarity: 566/696 (81.3%)
# Gaps: 78/696 (11.2%)
# Score: 2913.5
#
#
#=======================================
EMBOSS_001 1 atgttgatgattaaaggaattatttttgatatggacggtgttttatttga 50
annaabi.ee 
